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三、撰写初稿
一篇文章通常包括背景介绍、研究方法、研究结果、讨论、结论、参考文献几个部分。文章的核心主题需要在摘要的结果部分进行强调、在摘要的结论部分进行重复、在文章的结果部分进行突出、在图表中体现、并在结论的首段再次强调。
推荐的文章写作顺序为：研究方法——图表——图表注释——研究结果——讨论——背景介绍——摘要。
在研究方法的撰写中，要描述人群的纳入/排除标准、样本量、数据收集工具、评价工具的可靠性、偏倚的控制、终点事件的变量选择标准、伦理、知情同意以及统计方法。对于常用的研究方法，可给出参考文献和简要介绍，对于新的研究方法，则应给出更多细节和使用该方法的原因。应避免在研究方法中给出具体数据，并建议在投稿前将此部分给统计师复核以确认统计分析描述是否正确。方法学描述要详细，操作上需具有可重复性。
书写研究结论时，应遵循一定的逻辑顺序：首先汇报入组情况、违反协议的情况，然后应首先给出研究的主要发现。不要重复图表中的所有数据，只对其中的重要方面进行描述。只汇报与研究相关的数据，使得数据展示尽可能地清晰简单。在书写中还应注意以下几点：要同时给出绝对值和百分比；不要将统计学差异等同于临床显著性；只给数据，不要进行讨论；尽量将数据进行有机整合，分段呈现。
讨论部分是最难写的，在书写讨论部分之前，先要明确下列几个问题：本研究揭示了什么问题？有什么临床意义？研究结果还有什么其他的可能解释？现有的其他研究是否与本研究有相似结果？本研究的优势和劣势？可能的推广性？下一步的研究方向？这几个问题明确之后，即可以此为线索进行讨论部分的书写。在书写讨论部分时，需要注意以下“五不要”：不要重复“背景”部分的内容；不要提出新的数据；不要仅仅重复展示结果部分的数据；不要强调自己的研究有多“成功”；不要讨论不重要的发现。讨论部分应该着重强调自己的研究与现有其他研究相比的创新性，并描述研究的优势与局限性，讨论尚未解决的问题和将来的研究方向，最后还应对研究发现的意义进行总结。